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技术专栏

生物数据分析

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序列的比对

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局部比对 ??Blast ;blat ;blastz ;GeneWise ;Fasta ;Exonerate ;Sim4

重复序列分析??RepeatMasker;Trf ;LTR_STRUC

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基因表达分析专题 ??EST(Expressed  Sequence  Tag)表达序列标签分析; EST分析流程;EST  Pipeline(BEP)

生物芯片(Microarray)分析??Motif预测 ;MEME/MAST系统; MDScan

蛋白质结构预测??Threading方法

 

生物学相关网址

功能基因组分析

Transcription profiling  technologies??http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ncicgap/expression_tech_info.html

Protocols for cDNA array technology  ??http://cmgm.stanford.edu/pbrown/array.html

Data management and analysis of gene expression arrays??http://www.nhgri.nih.gov/DIR/LCG/15k/HTML

GeneFiltersTM(Research Genetics)??http://www.resgen.com

Gene Discovery Arrays (Genome Systems)??http://www.genomesystems.com

AtlasTM Arrays (CLONTECH)??http://www.clontech.com 

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Primer3(PCR引物设计??http://frodo.wi.mit.edu/cgi-bin/primer3/primer3_www.cgi

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多种数据库、分析工具和生物信息学机构??http://www.unl.edu/stc-95/Restools/biotools

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Comparative sequence analysis??http://www.bork.embl-heidelberg.de/ 

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