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行业动态

COVID-19检测小贴士
为了支持新型冠状病毒(COVID-19)的检测及疫苗研发工作,美国疾病预防控制中心(CDC)和中国政府都已完成了新型冠状病毒基因组的测序并将结果提交至US NCBI GenBank®数据库 [1]。近日,IDT收到了来自世界各地研究人员关于新型冠状病毒检测试剂盒的询问,以下是部分简要说明。

美国疾病预防控制中心

美国疾病预防控制中心检测试剂盒* 靶向COVID-19核衣壳蛋白基因(N-基因)上的不同位点。该试剂盒中的3组引物/探针必须与靶向人RNase P基因的内部对照同时运行。每个患者样本共需进行4次qPCR检测

1.该检测试剂盒采用一步法qPCR反应(即逆转录和后续qPCR反应在同一步骤中完成);

2.所有3次N-基因检测只有在Cq <35时方可视为阳性结果;

3.RNase P内部对照反应是关键。Cq >35表示样本提取不佳,需要重复实验;

敬请查阅最新的美国疾病预防控制中心 COVID-19 RT-PCR检测方法实验室指南,获取相关文档及实验方案。

与其他检测试剂盒的比较

世界卫生组织(WHO)

世界卫生组织实验方案不同于美国疾病预防控制中心实验方案。世界卫生组织建议需进行3次qPCR反应来确认是否感染COVID-19。尽管这是一套完整的实验方案,但没有美国疾病预防控制中心检测方法来得快,因为它需要连续进行3次检测,且必须观察到阳性结果才能进行下一次检测。该实验方案按如下顺序进行检测:

1.冠状病毒E-基因

2.RdRP基因:针对SARS 冠状病毒和其他蝙蝠相关冠状病毒

3.RdRP基因:针对COVID-19

中国疾病预防控制中心

中国疾病预防控制中心检测试剂盒建议采用2组引物/探针。第1组靶向ORF 1ab,第2组用于确认COVID-19的N-基因。

对照组

初步的电子模拟分析表明,搭配使用 IDT N-基因阳性对照组模板**与美国疾病预防控制中心检测试剂盒,与使用中国疾病预防控制中心、泰国卫生部以及HKU的引物/探针组进行类似实验获得的结果相符。当然,这是基于电子模拟研究,建议用户在自己的实验室中对所选试剂盒进行验证。


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